平成14（2002）年10月，土浦日本大学中等教育学校の前身となった土浦日本大学中学校が茨城県の認可を受けた。この年は，小学校中学校で新学習指導要領が実施され，公立学校で完全週休2日制が実施されるようになった，教育的にも大きな意味を持った年である。
同時に 「総合的な学習」の時間が新設され，高校に於いては情報科が認められるなどの動きもある中で，新設の中学校ではあるが，「日本大学の目的および使命に基づき，国家社会の有為な人材を育成する。」という建学の精神のもと設立され，総合的な学習を活用したプログラムを作り，情報を駆使して国際的に活躍する人材の育成を目指すという意欲にあふれた開校であった。新しい教育を行う学校としての期待も大きいスタートであった。
- 2003平成15年
- 4月
- 土浦日本大学中学校開校・第1回入学式
- 7月
- 土浦日本大学中学校校舎竣工（鉄筋・鉄骨コンクリート造地上6階建）普通教室12・理科室2・英会話室2・美術室・オーデトリアム・カフェテリア2・職員室・保健室・自習室・事務室等
- 第1回英国（サフランウォールデン）研修実施
- 2004平成16年
- 4月
- 土浦日本大学中学校第2回入学式
- 7月
- ハワイ・セントルイス高校との姉妹校締結
- 10月
- 2年生関西研修（京都・奈良）
- 2005平成17年
- 4月
- 土浦日本大学中学校第3回入学式
- 7月
- 総合学習情報センター竣工（図書室3）
- 3年生英国（オックスフォード）研修実施，1年生（カンタベリー）研修実施
- 2006平成18年
- 4月
- 土浦日本大学中学校第4回入学式
- 10月
- 4年生広島研修実施
- 土浦日本大学中等教育学校設置認可（茨城県認可）
- 2007平成19年
- 3月
- 土浦日本大学中学校廃校
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校開校（茨城県初，日本大学附属校初）
- 土浦日本大学中等教育学校開校式挙行・校歌制定
- 土浦日本大学中等教育学校第1回入学式
- 6月
- 5年生米国（ボストン）研修実施
- 2008平成20年
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第2回入学式
- 第二桜心館開館
- 2009平成21年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第1回卒業式
- 技術棟竣工
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第3回入学式
- 2010平成22年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第2回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第4回入学式
- 2011平成23年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第3回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第5回入学式
- 2012平成24年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第4回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第6回入学式
- 右籾桜グラウンド竣工
- 2013平成25年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第5回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第7回入学式
- 7月
- 2年生英国（バンバリー，チューダーホール）研修実施
- 4年生英国（ケンブリッジ）研修実施
- 11月
- 3年生広島研修実施
- 2014平成26年
- 2月
- 1年生関西研修（京都・奈良）
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第6回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第8回入学式
- 2015平成27年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第7回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第9回入学式
- 2016平成28年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第8回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第10回入学式
- 第三桜心館開館
- 2017平成29年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第9回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第11回入学式
- 2018平成30年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第10回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第12回入学式
- 2019平成31年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第11回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第13回入学式
- 理系インターコース開設
- 2020令和2年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第12回卒業式
- 新型コロナウイルス感染症の影響により休校（令和2年3月2日～）
※ICTを活用したオンライン指導を行う
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第14回入学式
- 6月
- 通常登校再開（令和2年6月8日～）
- 11月
- 1年生東北研修実施
- 3年生広島研修実施
- 2021令和3年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第13回卒業式
- 4月
- 副校長 松原大輔就任
- 土浦日本大学中等教育学校第15回入学式
- 2022令和4年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第14回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第16回入学式
- 7月
- 5年生長崎研修実施
- 2023令和5年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第15回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第17回入学式
- 7月
- 2年生英国（オークハム）研修実施
- 5年生英国（ロンドン）研修実施
- 4年生英国（ロンドン）研修実施
- 2024令和6年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第16回卒業式
- 4月
- 土浦日本大学中等教育学校第18回入学式
- 2025令和7年
- 3月
- 土浦日本大学中等教育学校第17回卒業式
- 4月
- 副校長 林敬道就任
- 土浦日本大学中等教育学校第19回入学式
歴代校長
土浦日本大学中学校
- 初代 福原 清三
- ２代 程塚 洋
土浦日本大学中等教育学校
- 初代 中川 弘
- ２代 西山 勝治
- ３代 堀切 浩一
